lets encrypt 導入後，cronの設定時には

・apache（httpd）
もしくは
・nginx

を止めてから，certbot-autoして，その後に起動をするように

こんな感じ
vi /etc/cron.d/letsencrypt

00 04 01 * * root /etc/rc.d/init.d/httpd stop && /usr/bin/certbot-auto renew && /etc/rc.d/init.d/httpd start